日本各地出现了异空间「魔都」── 　　由于只有女性能从魔都的「桃」得到特异的能力， 　　因此便由女兵组成了「魔防队」。 　　某一天， 　　过着抑郁生活的男高中生──和仓优希 　　不小心闯进了突发性产生的魔都入口， 　　在那里，遇到了「魔防队」第七组的美丽队长──羽前京香， 　　而她竟向优希宣言：「我要你当我的奴隶。」...

总有一天不论如何都要一起制作动画——上山高中动画同好会的5人向葫芦屋的甜甜圈如此起誓。她们毕业以后，分别在各自的岗位从事动画制作，并通过《第三飞行少女队》而接近了自己的梦想。　　4年后——。在动画的世界找到了自己的容身之所、逐渐成长起来的5人，开始面对新的苦恼和试炼。...

这是一个魔法少女的存在获得了认可的世界。一款名为《魔法少女育成计划》的游戏能够万里挑一制造出真正的魔法少女，而等待着这些幸运女孩们的，将会是万人的仰慕和光明的前途。然而，某一日，运营方忽然宣布要将魔法少女的数量削减一半，而方法，竟然是让现存的魔法少女进行残酷的竞赛。　　天真善良的少女白雪（东山奈央 配音）、外冷内热的忍者波纹（沼仓爱美 配音）、背负着巨剑的圣少女（佐仓绫音 配音）、骑着扫帚大大咧咧...